单细胞表观多组学方案
SeekSpace® 空间转录组方案
单细胞转录组方案
中性粒细胞会如何影响多组学数据的质控指标？
2026-05-21
中性粒细胞被激活 (如受炎症刺激) 时,染色质会解聚并释放到细胞外,形成与组蛋白结合的“中性粒细胞胞外诱捕网” (NETs),以清除病原体。这类事件会产生大量、分布随机的小 DNA 片段,在测序数据中表现为：
TSS 富集度、overlap Peaks 等指标显著下降。
染色体上这些碎片的占比可高达 60%,且大部分难以被归入 ATAC 调用的 Peak 区域。
包含大量此状态中性粒的样本不适合做 scATAC-seq 测序。
未被激活、处于静息 (终末分化) 状态的中性粒细胞,尽管整体转录活性较低,但其染色质结构完整,各项常规质控指标 (如 TSS.enrichment、overlap Peaks 等) 通常处于正常范围,仅基因表达量 (nFeature_RNA、nCount_RNA) 与 ATAC 片段总量 (nCount_ATAC) 中位数相对较低。这属于生理现象,实际数据中也常见。
文件：
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