一胞双组【DNA甲基化+RNA】-SeekGene

一胞双组【DNA甲基化+RNA】

同一细胞，多维洞察！技术创新赋能产品创新！

高通量与高捕获效率、一胞多维信息共检、高分辨率解析细胞异质性

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技术简介

SeekOne^® DD单细胞DNA甲基化+转录组组学技术，可实现同一细胞层面转录组、免疫组库和DNA甲基化的多文库同步构建，一次性捕获基因表达、表观遗传修饰、CNV、免疫功能多维度信息，为单细胞多组学研究提供更全面、精准的分子机制解析视角。

优势亮点

一胞多组同步解析

同时捕获DNA甲基化+RNA+VDJ多维信息，同步解析肿瘤CNV信息

高通量灵活捕获

单次灵活适配500-12000个细胞，兼顾珍稀样本与大队列分析需求

精准标签匹配

单标签水凝胶微珠实现单细胞甲基化与转录组信息一对一锁定

多物种、样本兼容

新鲜/冻存组织、新鲜/冻存细胞（核）样本兼容

文库干扰控制

生物素修饰标签标记DNA，高效分离纯化，降低基因组对RNA文库干扰

温和酶转技术

C-T酶学转换，温和反应，最大程度减少基因组DNA损伤

物种和样本类型

实验涉及样本 500 +

物种

人

鼠

猴子

牛

猪

羊 More +

样本类型

脑

肝脏

肺

骨髓细胞

前列腺癌

乳腺癌

胶质瘤

血液

动脉硬化斑块

睾丸

耳蜗

椎间盘

胚胎

食管癌 More +

技术流程

: 细胞（核）悬液制备、质检

: 细胞（核）固定及核小体去除

: 油包水制备、破乳

: C-T转化

: 文库构建、测序

: 数据分析

技术应用

肿瘤研究

解析肿瘤微环境，追溯肿瘤克隆演化路径、早期诊断与筛查标志物、解析肿瘤异质性

更多详情 +

衰老研究

衰老与疾病、器官衰老、免疫衰老、衰老标志物、衰老干预

更多详情 +

发育分化研究

胚胎发育、干细胞全能性与分化调控、组织器官发育异常研究

更多详情 +

脑科学研究

脑发育机制、学习与记忆、精神疾病、神经退行性疾病

更多详情 +

数据表现

物种

组织类型

MET Raw bases(G)

Estimated number of cells

GEX Median genes per cell

MET CpG number of median cell

MET Genome Coverage Rate of Median Cell

MET Read Pairs of Median Cell

MET Saturation of Median Cell

MET Fraction Read Pairs in Cells

物种：人

组织类型： PBMC

MET Raw bases(G)： 1,120

Estimated number of cells： 7,076

GEX Median genes per cell： 1,589

MET CpG number of median cell： 227,276

MET Genome Coverage Rate of Median Cell： 0.67%

MET Read Pairs of Median Cell： 173,955

MET Saturation of Median Cell： 27.49%

MET Fraction Read Pairs in Cells： 87.37%

物种：猕猴

组织类型：脑

MET Raw bases(G)： 979

Estimated number of cells： 9,058

GEX Median genes per cell： 2,010

MET CpG number of median cell： 198,232

MET Genome Coverage Rate of Median Cell： 0.61%

MET Read Pairs of Median Cell： 153,201

MET Saturation of Median Cell： 23.18%

MET Fraction Read Pairs in Cells： 98.48%

物种：食蟹猴

组织类型：视网膜

MET Raw bases(G)： 924

Estimated number of cells： 4,350

GEX Median genes per cell： 1,423

MET CpG number of median cell： 153,521

MET Genome Coverage Rate of Median Cell： 0.54%

MET Read Pairs of Median Cell： 171,877

MET Saturation of Median Cell： 38.30%

MET Fraction Read Pairs in Cells： 95.14%

物种：人

组织类型：胚胎

MET Raw bases(G)： 1,420

Estimated number of cells： 15,410

GEX Median genes per cell： 3,256

MET CpG number of median cell： 186,916

MET Genome Coverage Rate of Median Cell： 0.53.%

MET Read Pairs of Median Cell： 293,506

MET Saturation of Median Cell： 32.91%

MET Fraction Read Pairs in Cells： 97.52%

物种：人

组织类型：肠癌

MET Raw bases(G)： 1,172

Estimated number of cells： 8,967

GEX Median genes per cell： 2,561

MET CpG number of median cell： 161,951

MET Genome Coverage Rate of Median Cell： 0.46%

MET Read Pairs of Median Cell： 120,288

MET Saturation of Median Cell： 29.05%

MET Fraction Read Pairs in Cells： 94.36%

物种：小鼠

组织类型：睾丸

MET Raw bases(G)： 1,345

Estimated number of cells： 13,530

GEX Median genes per cell： 1,392

MET CpG number of median cell： 111,599

MET Genome Coverage Rate of Median Cell： 0.44%

MET Read Pairs of Median Cell： 113,868

MET Saturation of Median Cell： 31.21%

MET Fraction Read Pairs in Cells： 94.84%

物种：人

组织类型：胃癌

MET Raw bases(G)： 1,028

Estimated number of cells： 7,129

GEX Median genes per cell： 1,621

MET CpG number of median cell： 93,864

MET Genome Coverage Rate of Median Cell： 0.30%

MET Read Pairs of Median Cell： 91,136

MET Saturation of Median Cell： 36.33%

MET Fraction Read Pairs in Cells： 70.56%

物种：小鼠

组织类型：肝脏

MET Raw bases(G)： 575

Estimated number of cells： 11,329

GEX Median genes per cell： 2,403

MET CpG number of median cell： 66,234

MET Genome Coverage Rate of Median Cell： 0.26%

MET Read Pairs of Median Cell： 58,882

MET Saturation of Median Cell： 26.79%

MET Fraction Read Pairs in Cells： 96.16%

物种：牛

组织类型：胎盘

MET Raw bases(G)： 1046

Estimated number of cells： 2,809

GEX Median genes per cell： 1,661

MET CpG number of median cell： 344,636

MET Genome Coverage Rate of Median Cell： 1.14%

MET Read Pairs of Median Cell： 348,950

MET Saturation of Median Cell： 33.48%

MET Fraction Read Pairs in Cells： 83.06%

物种：牛

组织类型：肌肉

MET Raw bases(G)： 215

Estimated number of cells： 11,138

GEX Median genes per cell： 1,664

MET CpG number of median cell： 45.596

MET Genome Coverage Rate of Median Cell： 0.14%

MET Read Pairs of Median Cell： 25,767

MET Saturation of Median Cell： 13.68%

MET Fraction Read Pairs in Cells： 90.04%

物种：羊

组织类型：胎盘

MET Raw bases(G)： 175

Estimated number of cells： 4,171

GEX Median genes per cell： 1,322

MET CpG number of median cell： 69,780

MET Genome Coverage Rate of Median Cell： 0.20%

MET Read Pairs of Median Cell： 47,171

MET Saturation of Median Cell： 24.85%

MET Fraction Read Pairs in Cells： 94.62%

物种：猪

组织类型：胎盘

MET Raw bases(G)： 180

Estimated number of cells： 4.318

GEX Median genes per cell： 1,855

MET CpG number of median cell： 98,514

MET Genome Coverage Rate of Median Cell： 0.28%

MET Read Pairs of Median Cell： 58,424

MET Saturation of Median Cell： 25.88%

MET Fraction Read Pairs in Cells： 90.53%

物种： C-T Conversion＞99%；Genome-wide MET CpG coverage Rate＞95%，可通过增加测序数据量，提升CPG检出数。

数据集

甲基化-人三阴性乳腺癌MDA-MB-231细胞系样本数据

样本来源：人三阴性乳腺癌MDA-MB-231细胞系—demo2
产品方案：SeekOne^® DD
DNA甲基化+RNA双组学
物种：人
组织类型：乳腺癌细胞系
样本保存：冻存
上机细胞数：5000
DNA甲基化测序数据量：480G
RNA测序数据量：40G
捕获类型：细胞核
分析软件：SeekSoulMethyl

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SeekOne® DD单细胞DNA甲基化+转录组

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常见问题解答

Q. 如何理解寻因生物的SeekOne® DD 单细胞 DNA甲基化+RNA 双组学技术

SeekOne® DD 单细胞 DNA甲基化+RNA 双组学技术，支持一次实验灵活捕获500-1200细胞，可在同一细胞中实现单细胞5’转录组与DNA甲基化信息的并行捕获。该试剂盒基于微流控芯片技术，整合了带有细胞条形码的凝胶微珠（Barcoded Beads）与油包水液滴（Water-in-Oil）系统，仅需一个细胞标签即可同步构建5’转录组与DNA甲基化两大核心文库。其中，转录组 cDNA 产物可直接用于免疫组库文库构建，匹配免疫相关研究需求；同时，DNA 甲基化数据可额外挖掘拷贝数变异（CNV）信息，进一步拓展基因组层面的研究维度。在单细胞精度下，研究者得以同时分析基因表达（转录组）、表观遗传修饰（DNA 甲基化）、基因组变异（CNV）、免疫功能（免疫组库）多维度信息，以揭示细胞异质性、追踪调控网络、解析表观遗传信息。

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