技术简介
SeekOne® DD单细胞多重探针连接(SeekOne® DD scMLPSeq)针对人类编码蛋白的18000+基因设计探针,搭配针对 FFPE 样本专门预解交联方案,更有利于多重探针的杂交,从而对不同降解程度样本尤其是FFPE 样本实现0的突破。
技术简介
优势亮点
1. 灵敏度更高
采用更灵敏多重连接探针进行捕获
2. 目标更明确、测序量更少
针对人类编码蛋白的18000+ 基因
物种和样本类型
实验涉及物种
实验涉及物种  1
实验涉及组织类型
实验涉及组织类型  50+
实验涉及样本
实验涉及样本  1000+
物种
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技术流程

FFPE样本细胞核或甲醛固定的细胞/核

探针及多重标签杂交

油包水连接及标记

文库构建

高通量测序

数据分析和可视化

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技术应用
1
利用FFPE样本记录的详尽的诊疗及随访数据,探究个体化治疗差异的原因
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2
利用原发灶已有的FFPE样本及复发的或者转移的FFPE样本或者新鲜样本,联合进行肿瘤时间动态的研究
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3
利用已有的FFPE样本,通过单细胞转录组为罕见疑难疾病的发病机制、治疗、患者生存改善提供理论基础
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数据表现
细胞数捕获1W左右,测序40G左右
物种
组织类型
Estimated number of cells
Median genes per cell
Sequencing Saturation
Total Genes Detected
物种:
组织类型: 宫颈癌
Estimated number of cells: 11,087
Median genes per cell: 1,487
Sequencing Saturation: 51.65%
Total Genes Detected: 18,498
物种:
组织类型: 宫颈癌
Estimated number of cells: 12,536
Median genes per cell: 1,259
Sequencing Saturation: 72.55%
Total Genes Detected: 18,492
物种:
组织类型: 肠癌
Estimated number of cells: 8,727
Median genes per cell: 1,857
Sequencing Saturation: 67%
Total Genes Detected: 18,054
物种:
组织类型: 肝癌
Estimated number of cells: 13,736
Median genes per cell: 833
Sequencing Saturation: 66.73%
Total Genes Detected: 18,534
物种:
组织类型: 肝癌
Estimated number of cells: 10,733
Median genes per cell: 759
Sequencing Saturation: 71.88%
Total Genes Detected: 18,506
物种:
组织类型: 前列腺癌
Estimated number of cells: 7,690
Median genes per cell: 797
Sequencing Saturation: 84%
Total Genes Detected: 17,916
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数据集
样本来源:人肝癌FFPE样本
产品方案:SeekOne® DD 多重探针
物种:人
组织类型:肝癌
样本保存:FFPE
上机细胞数:20,000
测序数据量:33G