单细胞表观多组学方案
SeekSpace® 空间转录组方案
单细胞转录组方案
一胞多检【RNA+细胞表面蛋白】
单胞解码：转录组+ 细胞表面蛋白，一次检测全覆盖，兼容免疫组库、CRISPR及靶向扩增测序
在单细胞水平上，同时捕获转录组信息及表面蛋白表达信息，突破了传统检测无法在同一细胞内同时追溯基因转录与蛋白表达的短板，实现了单细胞分子机制与细胞表面功能表型的协同表征。
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技术简介
SeekOne® DD 单细胞5'转录组+表面蛋白测序技术基于微 流控技术原理，同时捕获单细胞内的RNA和结合在细胞表面蛋白的抗体核酸标签信号，实现RNA表达与表面蛋白表达的定性和定量检测。
数据表现
细胞数捕获1W左右，转录组测序100G左右，表面蛋白测序10G左右
Specles
Sample
Estmated Number Cells
Median Genes per Cell
Sequencing Saturation
Reads Mapped Confidently to Genome
Fraction Reads in Cells
Total Genes Detected
Specles： 小鼠
Sample： 皮下瘤
Estmated Number Cells： 11308
Median Genes per Cell： 2841
Sequencing Saturation： 43.25%
Reads Mapped Confidently to Genome： 89.64%
Fraction Reads in Cells： 87.22%
Total Genes Detected： 25468
Specles： 小鼠
Sample： 肝癌
Estmated Number Cells： 12286
Median Genes per Cell： 2652
Sequencing Saturation： 53.47%
Reads Mapped Confidently to Genome： 91.52%
Fraction Reads in Cells： 89.91%
Total Genes Detected： 24109
Specles： 人
Sample： 肺癌
Estmated Number Cells： 10171
Median Genes per Cell： 3156
Sequencing Saturation： 44.96%
Reads Mapped Confidently to Genome： 86.99%
Fraction Reads in Cells： 91.56%
Total Genes Detected： 31079
Specles： 人
Sample： PBMC
Estmated Number Cells： 10732
Median Genes per Cell： 2852
Sequencing Saturation： 55.20%
Reads Mapped Confidently to Genome： 92.42%
Fraction Reads in Cells： 88.38%
Total Genes Detected： 27522
Specles： 人
Sample： 结直肠癌
Estmated Number Cells： 11209
Median Genes per Cell： 2584
Sequencing Saturation： 47.17%
Reads Mapped Confidently to Genome： 88.51%
Fraction Reads in Cells： 86.24%
Total Genes Detected： 29681
Specles
Sample
Estimated Number of Cells
Fraction Antibody Reads
Fraction Antibody Reads usable
Fraction Unrecognized Antibody
Sequencing Saturation
Specles：小鼠
Specles：皮下瘤
Specles：11308
Specles：95.64%
Specles：52.88%
Specles：4.36%
Specles：68.28%
Specles：小鼠
Specles：肝癌
Specles：12286
Specles：98.13%
Specles：59.25%
Specles：1.87%
Specles：59.64%
Specles：人
Specles：肺癌
Specles：10171
Specles：92.51%
Specles：54.37%
Specles：7.49%
Specles：53.95%
Specles：人
Specles：PBMC
Specles：10732
Specles：93.67%
Specles：63.94%
Specles：6.33%
Specles：48.00%
Specles：人
Specles：结直肠癌
Specles：11209
Specles：95.39%
Specles：61.98%
Specles：4.61%
Specles：55.68%
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