单细胞表观多组学方案
SeekSpace® 空间转录组方案
单细胞转录组方案
技术简介
SeekOne® DD 单细胞全序列转录组采用12N7K半随机引物捕获RNA，打破常规单细胞转录组只能检测靠近mRNA 3’或5’序列的局限；同时，检测扩展到原核生物和RNA降解样本。通过专利性blocker，抑制随机引物抓取的rRNA扩增，90%以上的样本rRNA残留低于2%，减少了数据的浪费。
数据表现
细胞数捕获1W左右,测序100G左右
物种
组织类型
Estimated number of cells
Median genes per cell
Valid Barcodes
Sequencing Saturation
Fraction Reads in Cells
Total Genes Detected
物种： 人
组织类型： PBMC
Estimated number of cells： 11,300
Median genes per cell： 3,025
Valid Barcodes： 92%
Sequencing Saturation： 64%
Fraction Reads in Cells： 90%
Total Genes Detected： 23,333
物种： 人
组织类型： 脑胶质瘤
Estimated number of cells： 10,292
Median genes per cell： 3,108
Valid Barcodes： 92%
Sequencing Saturation： 78%
Fraction Reads in Cells： 92%
Total Genes Detected： 30,560
物种： 人
组织类型： 垂体瘤
Estimated number of cells： 12,893
Median genes per cell： 4,300
Valid Barcodes： 90%
Sequencing Saturation： 74%
Fraction Reads in Cells： 95%
Total Genes Detected： 31,476
物种： 小鼠
组织类型： 宫颈
Estimated number of cells： 10,956
Median genes per cell： 2,560
Valid Barcodes： 95%
Sequencing Saturation： 46%
Fraction Reads in Cells： 95%
Total Genes Detected： 27,033
物种： 小鼠
组织类型： 肺
Estimated number of cells： 9,551
Median genes per cell： 1,566
Valid Barcodes： 91%
Sequencing Saturation： 77%
Fraction Reads in Cells： 92%
Total Genes Detected： 22,006
物种： 小鼠
组织类型： 骨髓
Estimated number of cells： 9,008
Median genes per cell： 1,745
Valid Barcodes： 90%
Sequencing Saturation： 59%
Fraction Reads in Cells： 86%
Total Genes Detected： 19,840
数据集
样本来源：人—PBMC
产品方案：SeekOne® DD
全序列转录组
物种：人
组织类型：PBMC
组织类型（标签）：PBMC
样本保存：新鲜
上机细胞数：5000
测序数据量：30G
测序数据量：30G
捕获类型：细胞
分析软件：SeekSoul Tools
产品方案：SeekOne® DD
全序列转录组
物种：人
组织类型：PBMC
组织类型（标签）：PBMC
样本保存：新鲜
上机细胞数：5000
测序数据量：30G
测序数据量：30G
捕获类型：细胞
分析软件：SeekSoul Tools
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