单细胞表观多组学方案
SeekSpace® 空间转录组方案
单细胞转录组方案
一胞多检【RNA+V(D)J】
单胞赋能：基因表达 + V(D)J全长，真实一一对应，兼容表面蛋白、CRISPR及靶向扩增测序
同时检测单细胞转录组和V(D)J全长，将细胞的功能状态与抗原识别特异性进行单细胞水平的“精准关联”，突破了单独检测两者的信息局限，实现了抗原特异性免疫细胞功能状态的精准解析。
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技术简介
SeekOne® DD单细胞5'转录组+免疫组库测序，基于微流控技术原理，利用Barcoded Beads实现单细胞的分离与标记，分别构建同一个样本的TCR/BCR全长免疫组库和转录组库，在单细胞水平上分析了免疫细胞的多样性和功能，为深入理解免疫系统的复杂性、开发新的治疗策略和药物靶点提供了强有力的工具。寻因单细胞免疫组库产品已实现人/小鼠，以及非人/小鼠免疫组库覆盖。
数据表现
细胞数捕获1W左右，转录组测序100G左右，免疫组测序10G左右
Specles
Sample
Estmated Number Cells
Median Genes per Cell
Valid Barcodes
Sequencing Saturation
Reads Mapped Confidently to Genome
Fraction Reads in Cells
Total Genes Detected
Specles： 人
Sample： PBMC
Estmated Number Cells： 12717
Median Genes per Cell： 2464
Valid Barcodes： 94%
Sequencing Saturation： 70%
Reads Mapped Confidently to Genome： 83%
Fraction Reads in Cells： 87%
Total Genes Detected： 28256
Specles： 人
Sample： PBMC
Estmated Number Cells： 11314
Median Genes per Cell： 2015
Valid Barcodes： 95%
Sequencing Saturation： 71%
Reads Mapped Confidently to Genome： 91%
Fraction Reads in Cells： 90%
Total Genes Detected： 27213
Specles： 人
Sample： PBMC
Estmated Number Cells： 6543
Median Genes per Cell： 2904
Valid Barcodes： 93%
Sequencing Saturation： 77%
Reads Mapped Confidently to Genome： 84%
Fraction Reads in Cells： 79%
Total Genes Detected： 26496
Specles： 小鼠
Sample： PBMC
Estmated Number Cells： 13148
Median Genes per Cell： 1850
Valid Barcodes： 95%
Sequencing Saturation： 55%
Reads Mapped Confidently to Genome： 88%
Fraction Reads in Cells： 86%
Total Genes Detected： 23609
Specles： 猴
Sample： PBMC
Estmated Number Cells： 8720
Median Genes per Cell： 1802
Valid Barcodes： 92%
Sequencing Saturation： 78%
Reads Mapped Confidently to Genome： 87%
Fraction Reads in Cells： 89%
Total Genes Detected： 24501
Species
Sample
Estimated Number of Cells
Cells With Producthve V-J Spanning Pair
Valid Barcodes
Reads Mapped to Any V(D)J Gene
Median IGH UMIs per Cell
Median IGK UMIs per Cell
Median IGL UMIs per Cell
Species：人
Species：PBMC
Species：1586
Species：97%
Species：98%
Species：93%
Species：12.5
Species：14
Species：11
Species：人
Species：PBMC
Species：1028
Species：85%
Species：99%
Species：95%
Species：8
Species：14
Species：12
Species：人
Species：PBMC
Species：822
Species：98%
Species：98%
Species：92%
Species：16
Species：16
Species：16
Species：小鼠
Species：PBMC
Species：1487
Species：84%
Species：99%
Species：97%
Species：8
Species：19
Species：4
Species：猴
Species：PBMC
Species：1822
Species：79%
Species：97%
Species：88%
Species：3
Species：11
Species：9
Species
Sample
Estimated Number of Cells
Cells With Producthve V-J Spanning Pair
Valid Barcodes
Reads Mapped to Any V(D)J Gene
Median TRA UMIs per Cell
Median TRB UMIs per Cell
Species：人
Species：PBMC
Species：5191
Species：74%
Species：98%
Species：94%
Species：3
Species：5
Species：人
Species：PBMC
Species：3984
Species：65%
Species：98%
Species：96%
Species：4
Species：3
Species：人
Species：PBMC
Species：2764
Species：78%
Species：98%
Species：94%
Species：3
Species：5
Species：小鼠
Species：PBMC
Species：3040
Species：63%
Species：91%
Species：91%
Species：2
Species：5
Species：猴
Species：PBMC
Species：3371
Species：56%
Species：98%
Species：86%
Species：2
Species：4
发文展示
06.15
2025
Oxygen/sulfate radicals-generating CaS2 O8 nanosonosensitizers induce PAN‐optosis and calcium overload for enhanced peritoneal metastasis immunotherapy
发表期刊：Science Bulletin
08.27
2024
TLR agonists promote formation of Tertiary Lymphoid Structure and improve anti-glioma immunity
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11.23
2024
Blockade of purine metabolism reverses macrophage immunosuppression and enhances anti-tumor immunity in non-small cell lung cancer
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03.07
2024
Network-based screening identifies sitagliptin as an antitumor drug targeting dendritic cells
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2025
Epitope focused vaccine immunogens design using tailored horseshoe shaped scaffold
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