单细胞表观多组学方案
SeekSpace® 空间转录组方案
单细胞转录组方案
为什么在 Signac 多组学 (ATAC + RNA) 数据分析时,不用 pct_reads_in_peaks 指标来过滤细胞？
2026-05-21
pct_reads_in_peaks (Peak 区 Reads 占比) 主要用于单组学 ATAC 质量控制,反映信噪比；单组学时没有其他数据支持,需要严格用它剔除低质量细胞。但在多组学数据中,RNA 信息可作为 ATAC 数据质控的互补。如果细胞的 RNA 数据表现好,即使 pct_reads_in_peaks 稍低也可能是生物学真实、有价值的细胞。部分亚型细胞天然 pct_reads_in_peaks 低,若强行筛选可能丢失关键信息。因此,Signac 在多组学中更关注 TSS.enrichment、nucleosome_signal 等稳健指标,通过 ATAC 与 RNA 交叉验证整体质量,无需强制用 pct_reads_in_peaks 过滤。
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