单细胞表观多组学方案
SeekSpace® 空间转录组方案
单细胞转录组方案
scATAC-seq和 scRNA-seq综合分析绘制胸腺 iNKT 细胞发育图谱并确定 Cbfβ 作用
发表期刊 ： Cell Discovery
发表时间 ： 2023年6月
材料与方法 ： 转基因小鼠胸腺细胞，scATAC-seq、scRNA-seq。
研究结果 ： 与传统 αβT 细胞不同，固有自然杀伤 T 细胞（iNKT 细胞）在胸腺中终末分化为功能性 iNKT1/2/17 细胞，但其亚群分化的潜在分子程序仍不明确。作者利用单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）和单细胞转座可及染色质测序（scATAC-seq），分析了胸腺 iNKT 四个发育阶段超 1.7 万个细胞的转录组，以及超 3.9 万个细胞的染色质可及状态，以定义其发育轨迹。研究鉴定了 iNKT 前体及各亚群的新特征，指出 iNKT2 和 iNKT17 的分化或在第 0 阶段（ST0）早期通过不同程序启动，iNKT1 则在 ST0 后发生；iNKT1/2 表型与功能具有广泛多样性，iNKT17 相对均一。此外，新发现的转录因子 Cbfβ 在 iNKT 前体中高表达，表达轨迹与已知发育相关转录因子 Zbtb16、Egr2 相似，可指导 iNKT 细胞命运并推动效应器表型分化；条件性敲除 Cbfβ 会阻断 iNKT 早期发育，严重损害 iNKT1/2/17 的分化。本研究揭示了 iNKT 细胞的不同发育程序及细胞多样性，明确 Cbfβ 是调控 iNKT 早期发育的关键转录因子。
附件：
扫码联系专属客服
