寻因单细胞CRISPR筛选采用的技术原理较CROP-seq或Perturb-seq相比有什么优势?

2026-05-21

1、Perturb-seq是通过检测表达框中单独的向导条形码序列来间接捕获sgRNA数据的,该序列是多聚腺苷化的,由于向导条形码与对应的sgRNA往往相距几千个碱基,因此可能发生病毒重组介导的条形码与sgRNA交换,导致数据准确性降低。寻因的单细胞CRISPR筛选方法则是直接捕获向导RNA序列,而不是推断的,数据准确性高。 2、CROP-seq是通过多聚腺苷化捕获向导序列,因此向导序列与细胞mRNA是一起建库的,这意味着CROP-seq需要以足够的深度对基因表达文库进行测序,才能检测到向导序列。寻因的单细胞CRIPSR筛选方法则通过富集向导序列构建独立的CRISPR文库,提高了想到序列的检出率,降低了测序负担。

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