寻因的单细胞胞内菌技术较INVADE-seq有哪些优化?
2026-05-21
INVADE-seq技术遵循5'端单细胞RNA测序标准流程,旨在最大化哺乳动物细胞存活率,且未对细胞裂解步骤进行修改以增强革兰氏阴性或革兰氏阳性细菌细胞的裂解效果,因此应用于细菌生物量低的样本将面临挑战,鉴定出的细菌相关细胞数量有限,细菌UMI计数偏低。鉴于此,寻因的单细胞胞内菌技术优化了实验流程,引入了额外的细菌壁裂解方案,改善了革兰氏阳性菌细胞和分枝杆菌等菌壁裂解困难细菌的检出;而且针对细菌16S rRNA逆转录后进行巢式富集,单独建库,提高了胞内菌信号检出灵敏度。
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