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单细胞转录组方案
为什么FFPE样本是风险样本？
2026-05-21
样本质量极易受前期制备、处理及保存环节影响,核酸尤其是RNA稳定性较差,降解风险高。
首先,在样本采集阶段,手术切除的组织若在室温放置时间过长,会造成细胞死亡、内源核酸发生降解,即便置于冰上,延迟处理也会不可逆损伤样本质量,对送检时限要求严格。
其次,福尔马林固定过程会造成核酸与蛋白质之间发生化学交联,且固定时间越长、交联程度越高,不仅会破坏核酸分子完整性,还会大幅提升后续核酸与蛋白的提取纯化难度；同时福尔马林渗透速度有限,厚大组织易出现固定不均匀的问题,进一步加剧样本质量差异。
再者,浸蜡包埋前若组织脱水不彻底,残留水分会持续造成生物分子降解,降低样本可用性。另外,包埋所用石蜡品质同样影响样本稳定性,高熔点石蜡以及含有蜂蜡等添加剂的石蜡,会加速生物分子降解、干扰核酸与蛋白回收提取。
最后,FFPE样本长期保存过程中RNA会持续性缓慢降解,常规室温保存条件下降解更为明显,即便低温保存也无法完全阻止分子损伤。
文件：
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