单细胞表观多组学方案
SeekSpace® 空间转录组方案
单细胞转录组方案
单细胞中蛋白质、转录组、克隆型及 CRISPR 扰动的多重检测
发表期刊 ： Nat Methods
发表时间 ： 2019年5月
材料与方法 ： 健康供体PBMCs、皮肤T细胞淋巴瘤CTCL患者样本，ECCITE-seq（一次分析可以获得单细胞层级的蛋白表达、转录组、克隆分型和CRISPR干扰效应信息）
研究结果 ： ECCITE-seq基于CITE-seq、5'端表面特征捕获联合5'端scRNA-seq，蛋白质标签和细胞标签的检测是通过两种不同的扩增手段实现的。CITE-seq工具包的增强功能可以详细描述单个细胞的表型和功能。结合克隆型信息以及表面蛋白标记物的表达信息，可以对感兴趣的特定细胞群进行精细分离，从而能够进一步确定各个集群的分子表型。类似于在本研究中使用的TCR克隆型信息，使用可表达的突变可以定义和进一步描述scRNA-seq数据集中的克隆种群，这种方法可以很容易地与ECCITE-seq结合。
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