单细胞表观多组学方案
SeekSpace® 空间转录组方案
单细胞转录组方案
肿瘤内微生物群对癌症空间和细胞异质性的影响
发表期刊 ： Nature
发表时间 ： 2022年11月
材料与方法 ： 11 名CRC患者的44 个肿瘤组织采用16S rRNA 基因测序分析肿瘤内微生物群的组成及异质性；1个CRC和1个OSCC肿瘤组织采用空间转录组技术确定患者组织内肿瘤微生物群落的身份和原位位置；7个OSCC 患者的新鲜肿瘤组织采用INVADEseq技术研究微生物驱动的单细胞异质性
研究结果 ： 本文研究了口腔鳞状细胞癌（OSCC）和结直肠癌（CRC）中微生物和宿主细胞在空间水平的相互作用，揭示了肿瘤内微生物群如何促进肿瘤异质性。INVADEseq技术发现OSCC中以梭杆菌（34%）和密螺旋体（29.8%）属的细菌为主，主要感染上皮细胞和巨噬细胞，在免疫和上皮细胞中驱动患者肿瘤的异质性。研究表明被细菌感染的癌细胞以单细胞的形式侵入其周围环境，并将免疫细胞募集到细菌区域。这项工作拓宽了目前微生物群与人类癌症的关联性分析研究，为深入了解肿瘤内微生物的功能提供了新的见解。
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