技术简介
SeekOne® DD单细胞5'转录组+免疫组库测序,基于微流控技术原理,利用Barcoded Beads实现单细胞的 分离与标记,分别构建同一个样本的TCR/BCR全长免疫组库和转录组库,在单细胞水平上分析了免疫细胞的多样性和功能,为深入理解免疫系统的复杂性、开发新的 治疗策略和药物靶点提供了强有力的工具。 寻因单细胞免疫组库产品已实现人/小鼠,以及非人/小鼠免疫组库覆盖。
技术简介
优势亮点
捕获全长V(D)J序列信息
研究包括CDR3序列在内的
全长V(D)J序列
V(D)J序列比对率高达95%
高效捕获
信息更全面
配对率高达98%
真实展示同一细胞的配对情况
揭示抗原特异性
获得同一细胞中的
转录组和V(D)J序列信息 4.一样双检,样本更节省,不惧样本量少(如穿刺样本)
一样双检
样本更节省,不惧样本量少(如穿刺样本)
技术流程
技术应用
01
正常和疾病状态下的单细胞多组学图谱景观
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02
揭示发育或疾病中细胞在转录和可及性间的异质性
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03
探寻疾病相关罕见细胞类型转录因子或其他靶点
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04
揭示GWAS易感位点的调控作用和分子机制
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05
揭示GWAS易感位点的调控作用和分子机制
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数据表现
细胞数捕获1W左右,ATAC和RNA各测100G左右
Type
样本类型
Estimated number ofcells
ATAC Median heusy fragments per cell
GEX Median genes percell
TSS enrichment score
ATAC Raw_bases
Estimated number ofcells
Estimated number ofcells
Estimated number ofcells
Type:
样本类型: 黑色素瘤
Estimated number ofcells: 9996
ATAC Median heusy fragments per cell: 9996
GEX Median genes percell: 9996
TSS enrichment score: 5.2
ATAC Raw_bases: 245G
Estimated number ofcells: 78.9%
Estimated number ofcells: 70G
Estimated number ofcells: 78.9%
Type:
样本类型: 黑色素瘤黑色素瘤黑色素瘤
Estimated number ofcells: 9996
ATAC Median heusy fragments per cell: 9996
GEX Median genes percell: 9996
TSS enrichment score: 5.2
ATAC Raw_bases: 245G
Estimated number ofcells: 78.9%
Estimated number ofcells: 70G
Estimated number ofcells: 78.9%
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数据集
样本来源:小鼠脑-demo1
产品方案:SeekOne® DD单细胞
ATAC+RNA双组学
物种:小鼠组织
类型:脑
样本保存:新鲜
上机细胞数:8000
ATAC测序数据量:80G
RNA测序数据量:140G
样本来源:小鼠脑-demo1
产品方案:SeekOne® DD单细胞
ATAC+RNA双组学
物种:小鼠组织
类型:脑
样本保存:新鲜
上机细胞数:8000
ATAC测序数据量:80G
RNA测序数据量:140G
样本来源:小鼠脑-demo1
产品方案:SeekOne® DD单细胞
ATAC+RNA双组学
物种:小鼠组织
类型:脑
样本保存:新鲜
上机细胞数:8000
ATAC测序数据量:80G
RNA测序数据量:140G
样本来源:小鼠脑-demo1
产品方案:SeekOne® DD单细胞
ATAC+RNA双组学
物种:小鼠组织
类型:脑
样本保存:新鲜
上机细胞数:8000
ATAC测序数据量:80G
RNA测序数据量:140G
样本来源:小鼠脑-demo1
产品方案:SeekOne® DD单细胞
ATAC+RNA双组学
物种:小鼠组织
类型:脑
样本保存:新鲜
上机细胞数:8000
ATAC测序数据量:80G
RNA测序数据量:140G
生信分析
SeekOne®DD单细胞ATAC+RNA双组学,同时配备寻因分析软件SeekArc Tools及云平台Seek Soul Online,为您提供一站式单细胞ATAC和转录组多组学解决方案。
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